Cytoscape(撮影編2-2)

「Cytoscapeを使いこなす ～インストール・基本操作編～」アップしました。

本家: http://togotv.dbcls.jp/20131017.html#p01

YouTube版: http://youtu.be/kfte60OO-60

Cytoscapeの使い方の資料としてこちらの講習会で使われたPDFも参考にさせていただいています。

応用編は多分2つに分かれますが、次のはこんなかんじです

galFiltered.csvのネットワーク読み込み

→galExpData.csvの属性値読み込み

→LayoutとViz Mapperで軽く見た目を整える

→Betweeness CentralityやらEdge Betweenessやらをノード、エッジの大きさ、太さに反映する(可視化する)

→Viz Mapperである属性値をノードの色に反映する

→フィルターをかける