2013-05-01から1ヶ月間の記事一覧

Galaxy ~2日目~

二日目ですが、今日は前作での作業の目的やら台詞やら構成やら考えるだけで終わってしまいました。 前回の動画にあった説明でヒトゲノム上の転写制御因子をリストアップしたページ上で「p53」を文字列検索するという作業が含まれていました。この作業の目的…

Galaxy ~1日目~

これまでやっていたEntrezですが、なくなってしまったのですね...... http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery Entrezのデザインの方が素敵だった気がするのですが。 今回からGalaxyに着手することになりました。 Galaxyは、Penn State University Center …

Unigene ~5日目~

今日は前回作成したものをあげました。 YouTube版:http://youtu.be/yiyLmea32lE 本家のほうが途中です。 中途半端なところですみません 5/24 追記 本家:http://t.co/rtUny0xR6E

Unigene ~4日目~

今日も引き続きUnigeneの動画作成でした。 手直しがメインで、Oさんにかなり手伝ってもらい、upしていませんが動画自体は出来上がりました。 また、内容に関しては、「Entrez」の読み方や「アノテーション」という言葉についての説明が追加されました。 次回…

Unigene 〜3日目〜

前回に引き続きビデオの作成です。 今回は一応最後の説明を終える部分までで行きました。 今回前作から新たに加えた主な要素は、FASTA形式でのファイル保存以外のページ•配列情報の保存方法の説明でした。 配列情報はファイル保存以外に以下のものがありまし…

Unigene  ~2日目~

今回からUnigeneの動画の撮影に入りました。 動画の展開はオリジナルに前回書いた追加要素を入れたものにします。 オリジナルに直す部分はなく、一部追加するだけなのですが、動画の作り方の勉強ということで(構成、言葉等はともかく)一から撮り直すことにな…

Unigene 〜1日目〜

0425に記録した時のものをそのまま掲載します。 単語Entrez:NCBI提供のデータベース統合検索システムUnigene:遺伝子のEST配列のデータベース。同じ遺伝子座からの転写量を同定し、EST:expressed sequence tag 転写産物の「目印」CDS:タンパク質コーディング…