2013-08-01から1ヶ月間の記事一覧
やったこと 「インストール・基本操作編」撮影の続き。 大体撮り終えましたが、エッジの色の変更を「unselected」の状態に対してでなく、「selected」の状態に対してやってしまっていたので、その部分を撮り直さないといけません。 それ以降の部分も動画とし…
今日やったこと 今回からCytoscapeの撮影に入りました。 一つ目は「インストール・基本操作編」です。 操作方法が変わっている以外ほぼ前作通りです。 Google画面開いたらドビュッシー生誕151周年仕様になっていたので、今回は一番最初の導入部分は撮らずに…
前回操作は確認しましたが、意味のよく分からない操作が多々あったので、今回はそれらを調べました。 また、前作の動画やPDFではノードやエッジのサイズはそのままでしたが、各遺伝子の中心性に応じてサイズを変える方法も気になったので調べました。 特に大…
今回はPDF資料の操作を試しました。 表記や微妙なレイアウトの違いはありましたが、問題なくできました。 前作の動画の流れ 1.インストール、基本操作の説明 2.サンプルデータの読み込み→部分パスウェイの抽出(フィルタリング)→発現量の強さの視覚化 前作か…
今度はCytoscapeを始めることになりました。 Cytoscapeとは、生物学的ネットワーク(グラフ)を可視化&解析できるオープンソースプラットフォームです。もともとは生物学的ネットワークのためにオブジェクト指向型言語Javaで書かれたソフトですが、もちろん…