2013-06-01から1ヶ月間の記事一覧

Galaxy ~6日目~

動画のCamtasia Studio8から7への作り変えをしました。 「8はキャプチャ無視して吹き出しが使えたのは楽だったな~」と思いました。 吹き出しの台詞が我ながらルー語じみているのですが、筆者にはもっといい書き方が思いつきません。 これくらいしか書くこと…

Galaxy ~5日目~

Galaxyでヒトゲノム上の遺伝子の上流200bpとP53の予測結合領域の共通領域をUCCS Genome Browserに出力したとき、例としてANKRD65(ankyrin repeat domain 65)を見てみました(単に一番最初に出てくるものであったため)。 すると、上流にも関わらず、染色体の…

Galaxy ~4日目~

前回、Galaxyで得た情報をUCSC Genome Browserで見るためのリンクがなくなっていたといったようなことを言いましたが、直していただきできるようになりました。 そこで、UCSC Genome BrowserとEnsemblで見る方法を紹介することになりました。

Galaxy ~3日目~

今回、手に入れたデータをUCSC Genome Browserで見ようとしたところ、以前はヒストリーにUCSC Genome Browserのリンクがあったのですがそれがなくなり代わりにIGB、Ensembl、RViewerのリンクができていました。 また、現在下記のような方法でUCSC Genome Bro…